日本船舶與海洋工程專業，大致可分為船舶系、海上海洋系以及環境系三種：船舶系的學習內容以船舶的設計、建造等造船技術為中心，也包括用于海洋開發的各類設備等；海上海洋系主要與海洋開發相關的領域，以及海上運輸系統、國際物流、后勤相關領域；環境系以環境保護與人類共存的課題為軸心，學習海洋環境、資源管理、水域利用等方法和技術。

日本目前開設船舶與海洋工程專業的大學有多所，國公立有：東京大學，大阪大學，九州大學，橫濱國立大學，大阪府立大學，廣島大學，東京海洋大學，神戶大學，其中東京大學只有研究生課程；私立有：東海大學，長崎綜合科學大學。